Футболен клуб Созопол официално стартира новата си история през 2008 година (много години преди това обаче има организиран футбол и клубове в града – виж по-долу.) Играе домакинските си мачове на стадион „Арена Созопол“ с капацитет 4000 места. Официалният цвят на екипите е изцяло в небесносиньо, а като резервен цвят се използва тъмно синьо, бордо или бяло. Созопол има 7 участия във „Б“ група (Втора лига) и 8 участия във „В“ група (Трета лига).
Първи организиран футбол в града
Началото на футболния живот в курортното морско градче стартира през 1945 година, когато местното физкултурно дружество носи името Септември. С това име обаче клубът съществува едва четири години и през 1949 година с оглед настъпващите политически промени по съветски модел се обособяват доброволни спортни организации на ведомствен принцип. Така е създаден клуб Продоволственик.
От 1957 година настъпват нови промени във футбола и всички по-малки организации или дружества са обединени в дружество за физическа култура и спорт Вапцаров. То съществува най-дълго – от 1957 чак до 1985 година, когато името е сменено на Ропотамо.
След демократичните промени, от 1993 година футболният клуб приема името на самия град – Созопол.
Предишни имена
1945 година – Септември
1949-1957 – Продоволственик
1957-1985 – Вапцаров
1985-1993 – Ропотамо
1993 – Созопол
Новата история
Футболен клуб Созопол на практика стартира новата си история през лятото на 2008 година, когато е включен в Югоизточната „В“ група. Първата и основна задача пред клубното и общинското ръководство е да бъде изградена модерна база (виж рубрика Стадион), на която да тренира и играе не само представителният мъжки отбор, но и подрастващите от детско-юношеската академия на клуба.
В първите два сезона в Югоизточната „В“ група Созопол се движи в средата на класирането без огромни амбиции за челото. През сезон 2010/2011 финишира на 4 място, но отново далеч дори от мястото, даващо право на участие на бараж за влизане в по-горната дивизия. През сезон 2011/2012 е 8-ми, 2012/2013 (9 място), за да се стигне до сезон 2013/2014, когато Созопол за първи път влиза в професионалния футбол (Б група).
Историческо първо участие в „Б“ група
През сезон 2013/2014 ФК Созопол печели Югоизточната „В“ група с 81 точки, като изпреварва само с 1 точка завършилия на второ място Мастер (Бургас). През сезона са записани 26 победи, 3 равенства и само 3 загуби. В последния кръг Созопол става шампион на Югоизточната „В“ група след победа с 3:0 над Асеновец. Попаденията за тима бяха реализирани от Станимир Баев, Любо Цеков и Кристиян Ватралев.
В първия си сезон във втора дивизия отборът финишира на 6-о място в крайното класиране. Сезон 2014/2015 на практика е дебютен за отбора в „Б“ група и никак не лош с оглед резултатите. В крайното класиране Созопол финишира с 46 точки (толкова има и петият Добруджа) след 12 победи, 10 равенства и 8 загуби. Отборът е много далеч от зоната на изпадащите, като оставя зад себе си исторически и традиционни отбори, сред които Ботев Враца, Спартак Варна, Черноморец Бургас, както Септември (Симитли), Пирин Разлог, Верея (Стара Загора) и други.
Успешният сезон 2015/2016
Следващият сезон 2015/2016 е най-успешният за Созопол. Отборът завършва на 4 място в „Б“ група и достига до четвъртфиналите в турнира за Купата на България.
За първенство Созопол събира 49 точки, като на 3 място завършва Локомотив Горна Оряховица с 50, а на второ място и участие на бараж завършва Поморие (54 точки). Така Созопол остава в подножието на втората позиция, разделен само от 5 точки. Активът на отбора през шампионата е 13 победи, 10 равенства и 7 загуби при голова разлика 44:28. От изиграни 15 домакинства през сезона Созопол регистрира 10 победи, 4 равенства и само 1 загуба (от Пирин Разлог).
Историческият 1/4-финал за Купата на България
В турнира за Купата на България Созопол достига до четвъртфиналите, което е най-големият успех за клуба в новата му история. Жребият отрежда още на 1/16-финалите отборът да се изправи срещу традиционния тим на Етър (Велико Търново) и то на негов терен. След 1:1 в редовното време и продълженията, Созопол се справя с 5:4 след изпълнение на дузпи.
На 1/8-финалите Созопол е домакин на елитния Ботев Пловдив и го изхвърля от надпреварата след минимална победа с 1:0 след единствено попадение на Емануил Манев.
На четвъртфиналите обаче жребият отново не е на страната на Созопол и тимът се изправя срещу ЦСКА на стадион „Българска армия“. Столичният тим тогава е във „В“ група, но е безпогрешен в абсолютно всички мачове от началото на сезона. Созопол губи с 0:3, като равенството се запазва чак до 78-ата минута, когато домакините от ЦСКА откриват резултата.
Изпадане до „В“ група и отново в „Б“ група
Следващият сезон 2016/2017 отново е много успешен за Созопол. Отборът повтаря класирането си от предходния шампионат, като завършва на 4 място. Този път още по-малко точки разделят отборът от участие на бараж – само 3. Созопол завършва с 50 точки на четвъртото място, докато трети е Витоша (Бистрица) с 53 точки.
Следващият сезон 2017/2018 обаче последва сериозен спад и отборът след няколко поредни сезона в „Б“ група изпада отново при аматьорите. През пролетта на 2018 година дългогодишният треньор Румен Димов напуска поста си, като е сменен от брат си – Маргарит Димов, а той остава в клуба като изпълнителен директор. До края на шампионата обаче Созопол не успява да се справи с трудната ситуация и завършва на предпоследното 15 място от 16 отбора (с 24 точки след 6 победи, 6 равенства и 18 загуби).
Сезон 2018/2019 Созопол бързо прави опит да се върне в „Б“ група, като изиграва много силен сезон, но има конкуренцията на Нефтохимик. Созопол печели 17 от 17 мача вкъщи и финишира само на 5 точки от „шейховете“ в крайното класиране. Созопол трябваше да бъде поканен във Втора лига, след като фалиралият Верея Стара Загора бе пратен при аматьорите, но БФС решава, че групата ще бъде съставена от нечетен брой – 17 тима. Така небесносините трябваше да чакат още един сезон, за да се завърнат в елита.
Сезон 2019/2020 обаче нещата идват на мястото си и Созопол става шампион в Югоизточната „В“ група. В крайното класиране тимът събира 45 точки от 14 победи, 3 равенства и 2 загуби. Сезонът е прекратен след 19 кръг поради пандемията от Ковид, като всички мачове и кръгове до края са анулирани. Така Созопол влиза в „Б“ група след изиграването на последния си мач на 29 февруари 2020 година.
През следващите два сезона (2020/2021 – 8 място във Втора лига) и 2022/2023 Созопол е част от Втора лига.
Успехи
„Б“ група/Втора лига
4 място (2): 2015/16, 2016/17
Югоизточна „В“ група
Шампион (2): 2013/14, 2019/20
Купа на България
1/4-финал: 2015/16